大きくわけて以下の違いあります。

オーナー:決済権限、チーム変更権限を持つ
管理者:チーム変更権限のみ持つ

<決済機能の例>
カード情報を変更/閲覧する
支払い履歴を閲覧する
インボイスを受信/閲覧する

<チーム変更機能の例>
誰かをチームに招待する
メンバーを管理者に設定する
メンバーを削除する 
*オーナーがオーナー自身を削除することは不可